La Basílica de Santa María la Mayor es la sede de diversas asociaciones de fieles, reconocidas canónicamente, que, con denominaciones distintas, tienen como fin profundizar en la vida cristiana a través de la devoción particular a algún misterio de la vida de Cristo, una advocación de la Virgen María o de algún Santo. A lo largo del año promueven diversas manifestaciones, tanto devocionales, como caritativas, culturales o sociales, preparadas por las diferentes vocalías en las que dichas Hermandades se encuentran organizadas.
Concretamente, existen cuatro Hermandades penitenciales, que participan en las procesiones de la Semana Santa y tienen por titular a Nuestro Señor Jesucristo en algún pasaje de Su Pasión y a la Virgen Santísima bajo diversas advocaciones:
Hermandad de la Santa Cena Sacramental y Nuestra Señora de la Paz
Real Hermandad y Cofradía de Ntro. Padre Jesús del Rescate y María Santísima de los Dolores
Hermandad y Cofradía de Nuestro Padre Jesús de la Columna y Nuestra Señora de la Amargura
Y también es la sede de tres Grupos Parroquiales, el de Nuestra Señora del Carmen, el de San Isidro y el reciente de Ntra. Sra. de la Victoria; y también de la Asociación de la Inmaculada Virgen María de la Medalla Milagrosa.